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環境微生物中的定量PCR

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環境(如土壤、糞便及水環境等)微生物種屬多樣性以及功能基因差異是目前農學和醫學研究的熱點之一。通過16s rRNA可變區的高通量測序,一定程度上對環境中的微生物進行了屬的鑒定。但對環境中的功能基因無法進行鑒定分析,目前還只能靠定量PCR方法進行檢測。

基本流程

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技術優勢

(1)?????? 本公司擁有多種微生物(如:總細菌、芽孢桿菌、氨氧化細菌等)檢測的質粒標準品,而且這些標準品擴增效率高,特異性強,方便的用于后續的細菌種屬的qPCR絕對定量分析。

(2)?????? 本公司構建了多種微生物的功能基因(如:nirSnirK以及nosZ等)質粒標準品,這些標準品擴增效率高,標準曲線相關系數(R2)均在0.98以上。

客戶須知:

環境微生物中的定量PCR

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周期

最終提供客戶資料

環境微生物中的定量PCR

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20-30個工作日(視樣品和基因數目而定

詳細實驗總結報告(包括基因組DNA提取、質粒標準品制備過程及測序、標準品和未知樣品擴增曲線、標準曲線、熔點曲線、相對表達分析結果,統計分析等)

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案例:

本實驗對土壤中反硝化細菌中的關鍵功能基因亞硝酸鹽還原酶(nirKnirS)和一氧化氮還原酶(nosZ)基因進行絕對定量分析,從而探討了氮相關功能微生物群落豐度與環境因子的關系。本實驗中的質粒標準品全部來自于本公司構建并測序,特異性和靈敏度較高。

?? 不同土壤樣品中nirSnirKnosZ基因擴增的標準曲線和擴增曲線

客戶提供:

樣品類型

土壤和糞便樣本

水環境樣本

樣品需要量

500 mg

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5ml

取樣和保存環境

無菌管收集,最好保存在-20℃或-80

無菌管收集、離心,最好保存在-20℃或-80

運輸

杭州市內干冰上門取樣;

外地客戶干冰快遞運輸;

組織保存液,冰袋運輸

杭州市內干冰上門取樣;

外地客戶干冰快遞運輸;

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*(經本公司評估后,實驗沒有結果,不收取任何費用)

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